El abogado Tristán Gavier, defensor de Cornejo Torino y Gatto, planteó la "nulidad absoluta" del juicio y argumentó que "los hechos que se describen en la acusación son generales, y no hacen referencia a las conductas y responsabilidades particulares". Los defensores oficiales Marcelo Arrieta, quien defiende a González de la Vega, y Hugo Burgos, defensor de Franke, se sumaron al mismo planteo.

Durante el proceso se incorporarán alrededor de 140 pruebas testimoniales, 80 escritas, y habrá 50 testigos, a quienes se sumarán más de 200 informes técnicos. El expresidente Menem y el exjefe del Ejército, Martín Balza, no serán parte del juicio porque fueron sobreseídos en segunda instancia y la apelación fiscal todavía está pendiente.