La lista de candidatos a ocupar el rectorado de la UBA entre 2006 y 2010 incluye al actual rector, Guillermo Jaim Etcheverry. Entre sus rivales figuran dos candidatos radicales: el decano de Derecho, Atilio Alterini, y el decano entrante de Farmacia, Alberto Boveris. Desde lo que fue el bloque que apoyó a Jaim Etcheverry en 2002 se desprenden las candidaturas de Aníbal Franco, ex decano de Veterinarias y referente del peronismo en la universidad, y de Fernando Vilella, decano saliente de Agronomía. Por el sector más progresista de la UBA, la única candidatura lanzada hasta hoy es la de Pablo Jacovkis, con adhesiones también del peronismo.