Fase inicial

26/8 Independiente-Argentinos	1-0	Galeano
9/9 Argentinos-Independiente	1-1	Gracián

Octavos de final

28/9 Defensor Sporting-Independiente	1-0
19/10 Independiente-Defensor Sporting	4-2	Silvera, Fredes, Cabrera, Martínez

Cuartos de final

3/11 Deportes Tolima-Independiente	2-2	Silvera, J.Velázquez
11/11 Independiente-Deportes Tolima	0-0

Semifinales

18/11 Liga de Quito-Independiente	3-2	Silvera, Mareque
25/11 Independiente-Liga de Quito	2-1	Parra, Fredes

Final

1/12 Goiás-Independiente	2-0
8/12 Independiente-Goiás	3-1	Parra (2), J.Velázquez

En los dos primeros partidos, ante Argentinos, el técnico de Independiente fue Daniel Garnero. La dupla integrada por Ricardo Pavoni y Francisco Sá dirigió al equipo en Montevideo, frente al Defensor Sporting. A partir de la revancha en Avellaneda, Antonio Mohamed se hizo cargo del plantel. En total, Independiente jugó diez partidos en esta campaña, con cuatro victorias, tres empates y tres derrotas (en Montevideo, Quito y Goiania), con 15 goles a favor y 13 en contra. Con tres goles cada uno, Andrés Silvera y Facundo Parra fueron los artilleros de la campaña.