Esta etapa del proyecto contó con la financiación del World Monuments Fund a través del Programa World Monuments Fund Robert Wilson Challenge to Conserve Our Heritage y el gobierno de la provincia de Misiones. Se contó con la colaboración de la Fundación Bunge y Born, Acindar y Fundación Acindar. Las tareas de restauración en campo fueron dirigidas por la arquitecta Gisela M. A. Korth. Los relevamientos estuvieron a cargo de la arquitecta Carola Herr. La coordinación general del proyecto fue realizada por el arquitecto Marcelo L. Magadán. La supervisión de obra fue del arquitecto José L. Pozzobón, director del Programa Misiones Jesuíticas del gobierno misionero y delegado de la Comisión Nacional de Museos, Monumentos y Lugares Históricos de la República Argentina en esa provincia.