Además, el juez enfrenta los mismos cargos por la investigación de los créditos otorgados por los bancos Nación y Provincia de Buenos Aires durante los años '90 a las curtiembres Yoma, empresa de la familia de la exesposa del entonces presidente Carlos Menem. Según la denuncia, Bonadío generó "con su conducta morosa y negligente un grave perjuicio al estado nacional, y afectado la eficaz prestación del servicio de justicia".

De acuerdo a las normas procesales, el juez puede realizar su descargo por escrito y lo evaluará la Comisión, en tanto será el plenario del cuerpo el que decida si abre, o no, la instancia del juicio político.