Eduardo Basualdo coordinó al equipo de investigación sobre el rol del Banco Nación durante la última dictadura militar, integrado por los economistas Juan Santarcángelo y Guido Perrone, la historiadora Cintia Russo y el sociólogo Andrés Wainer. En esos años se adjudicó un grado militar a cada trabajador del Banco Nación, de general a soldado, y se los sometió al código y a los tribunales de justicia militar. En las instalaciones hubo una cárcel donde se practicaron torturas y decenas de trabajadores fueron detenidos desaparecidos. Los préstamos del Banco Nación se redujeron a la mitad: del 19 al 10 por ciento del crédito total otorgado por el sistema financiero local. Y además se invirtió el origen de los recursos prestados: en 1975 el 80 por ciento de los créditos institucionales provenían de los depósitos internos y en 1983 de créditos internacionales. Las sucursales del BN en el exterior tomaban deuda y la represtaban a entidades públicas locales y privadas del exterior. No sólo se abrieron sucursales en los países centrales sino también en Panamá, donde tuvo una notable actividad, en desmedro de las sucursales en Estados Unidos, para eludir cualquier bloqueo que pudiera determinar el gobierno de James Carter por las violaciones a los derechos humanos cometidas en la Argentina. Igual que empresas como YPF, el BN fue utilizado para obtener las divisas que hicieron posible la valorización financiera y la fuga de capitales. Los investigadores partieron con la hipótesis de que esos recursos serían prestados a las empresas. Con sorpresa constataron que el principal tomador no fue el sector privado, sino los comandos en jefe de las tres fuerzas armadas por 5.000 millones de dólares, equivalentes a 22.500 millones de hoy. El año clave de ese endeudamiento castrense fue 1979, cuando comenzó a aplicarse “el ajuste monetario de balanza de pagos” con su célebre tablita, la CGT realizó su primer paro general y la Comisión Interamericana de Derechos Humanos constató en el país el carácter sistemático y masivo de las violaciones a los derechos humanos. El libro con la investigación fue publicado por Siglo XXI.