El voto fue realizado en forma secreta por los miembros de ambas cámaras del Parlamento paquistaní y las cuatro asambleas provinciales.

Según la BBC, el presidente fue elegido por cuatro asambleas provinciales, tras obtener 481 votos sobre un total de 702. La jornada estuvo enmarcada por un atentado en la ciudad de Peshawar, noroeste del país, tras estallar un coche-bomba que mató al menos 15 personas en un puesto de bloqueo policial.

Peshawar es la capital de la Provincia Noroccidental Paquistaní (NWFP), en la frontera con Afganistán.

El atentado ocurrió en el puesto de control policial de Zangi, en la ruta de Kohat, donde varios edificios se derrumbaron y numerosas personas se encontraban atrapadas bajo los escombros.

Zardari fue electo con gran ventaja sobre sus dos rivales directos en la contienda, Saeed-uz-Zaman Siddiqui de la Liga Paquistanpi Musulmana-N (PML-N) de Nawaz Sharif y Mushahid Hussain Syed de la Liga Paquistaní Musulmana-Q (PML-Q) cercana a Musharraf.